九月
十二日 行政長官出席在新西蘭奧克蘭舉行的亞太區經濟合作組織論壇，與各地領袖一同參加主要會議。
十六日 在颱風約克肆虐下，香港自一九八三年以來首次懸掛十號颶風信號。這次颱風襲港導致兩名男子喪生、五百多人受傷、數以百計的樹木連根拔起、多條道路受阻。
十八日 海關關長曾俊華宣布香港的盜版活動受到控制。
二十日 財政司司長抵達美國拉斯維加斯，展開為期11日的訪美行程，期間共訪問四個城市，包括到華盛頓參加國際貨幣基金組織／世界銀行年會。
二十二日

機場管理局宣布由二零零零年一月一日起，將飛機着陸費和停泊費調低15%。

由於台灣發生大地震，香港遣派一支由消防員和救護員組成的志願救援隊前往該處，協助進行拯救工作。
二十四日 政府在憲報刊登有關地下鐵路公司部分股權私有化的條例草案。
二十六日 另一強烈熱帶風暴錦雯吹襲香港，導致一人死亡，二十多人受傷，以及廣泛地區水浸。這是年內第五次懸掛八號或以上熱帶氣旋警告信號，與一九六四年的最高紀錄相同。五個熱帶氣旋中，有四個正面吹襲香港，打破了一九六四年兩個的紀錄。
二十九日 財政司司長於結束訪美行程前，在華盛頓與美國財政部長薩默斯會面。